高壓均質機主要由高壓均質腔和增壓機構構成。高壓均質腔的內部具有特別設計的幾何形狀，在增壓機構的作用下，高壓溶液快速地通過均質腔，物料會同時受到高速剪切、高頻震蕩、空穴現象和對流撞擊等機械力作用和相應的熱效應。

    由此引發的機械力及化學效應可誘導物料大分子的物理、化學及結構性質發生變化，最終達到均質的效果。因此，高壓均質腔是設備的核心部件，其內部的特有的幾何結構是決定均質效果的主要因素。

    而增壓機構為流體物料高速通過均質腔提供了所需的壓力，壓力的高低和穩定性也會在一定程度上影響產品的質量。一般情況下，均質壓力越高越好。首先，均質壓力越高，均質后的物料粒徑將越小越均勻。

    這就使設備的效率更高，可以通過更少的循環次數達到期望的效果；其次，均質壓力越高，可以處理的物料種類越多。例如，某些液體乳劑只需要在20000psi就可以均質到100nm以下，而某些含有較高密度固體顆粒的混懸液，則至少要26,000psi以上的壓力下才能處理到納米級。